1. 離子交換樹脂在長期儲存中，或需在停用設備內長期存放，強型樹脂（強酸性和強堿性樹脂）應轉為鹽型，弱型樹脂（弱酸性和弱堿性樹脂）可轉為相應的氫型或游離胺型，也可轉變為鹽型，以保持樹脂性能的穩定。然后浸泡在潔凈的水中。停用設備若須將水排去，則應密封，以防樹脂中水份散失。
2. 離子交換樹脂內含有一定的平衡水份，在儲存和運輸中應保持濕潤，防止脫水。樹脂應儲存在室內或加遮蓋，環境溫度以5℃~40℃為宜。袋裝樹脂應避免直接日曬，遠離鍋爐、取暖器等加熱裝置，避免脫水。
若發現樹脂已有脫水現象，切勿將樹脂直接放于水中，以免干樹脂遇水急劇溶脹而破碎。應根據其脫水程度，用10%左右的食鹽水慢慢加入到樹脂中，浸泡數小時后用潔凈水逐步稀釋。
3. 當環境溫度在0℃或以下時，為防止樹脂因內部水份結冰而崩裂，應做好保溫措施，或根據氣溫條件，將樹脂存于相應濃度的食鹽水中，防止冰凍。若發現樹脂已被凍，則應讓其緩慢自然解凍，切不可用機械力施于樹脂。
食鹽溶液濃度與冰點的關系如下表：
濃度 | 5 % | 10 % | 15 % | 20 % | 23.5 % |
冰點 | -3 ℃ | -7 ℃ | -10.8 ℃ | -16.3 ℃ | -21.2 ℃ |
4. 長期停用而放置在交換器內的樹脂，為防止微生物（如藻類、細菌等）對樹脂的不可逆污染，樹脂在停用前須徹底反洗，以除去運行時積聚的懸浮物質，并注意定期沖洗和換水。或徹底反洗后采用以下措施：
陰樹脂：用3倍樹脂體積的10% NaCl + 2 % NaOH 混合液分兩次通過樹脂層，每次靜止浸泡數小時，然后將其排去。如有必要，在重新啟動前用2倍樹脂體積的0.2 %過氧化氫（H2O2）溶液淋洗樹脂層。
陽樹脂：在陽離子交換器及管系內可充入0.5 % 的甲醛溶液，并在停用期間保持此濃度。也可用食鹽水浸泡。在設備重新啟動前用0.2 %過氧化氫或0.5 %甲醛溶液淋洗。
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